FlyAtlas 2 – Gene
For a particular Drosophila gene, find the pattern of expression in different tissues.
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Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene:
| Adult Male | Adult Female | Male v. Female | Larval | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tissue | FPKM | Enrichment | FPKM | Enrichment | M/F | p value | FPKM | Enrichment |
| Head | 305 ± 15 | 1.9 | 228 ± 60 | 3.2 | 1.33 | n.s. | ||
| Eye | 236 ± 32 | 1.5 | 178 ± 7.5 | 2.5 | 1.33 | n.s. | ||
| Brain / CNS | 252 ± 33 | 1.6 | 224 ± 31 | 3.1 | 1.13 | n.s. | 79 ± 10 | 2.3 |
| Thoracicoabdominal ganglion | 400 ± 45 | 2.5 | 388 ± 28 | 5.4 | 1.03 | n.s. | ||
| Crop | 88 ± 6.1 | 0.6 | 65 ± 16 | 0.9 | 1.34 | n.s. | ||
| Midgut | 111 ± 34 | 0.7 | 34 ± 3.7 | 0.5 | 3.3 | n.s. | 25 ± 0.4 | 0.7 |
| Hindgut | 390 ± 36 | 2.5 | 391 ± 56 | 5.4 | 1.00 | n.s. | 88 ± 22 | 2.6 |
| Malpighian Tubules | 618 ± 89 | 3.9 | 583 ± 43 | 8.1 | 1.06 | n.s. | 145 ± 9.3 | 4.3 |
| Fat body | 46 ± 4.4 | 0.3 | 39 ± 4.3 | 0.5 | 1.16 | n.s. | 26 ± 2.4 | 0.8 |
| Salivary gland | 100 ± 1.2 | 0.6 | 65 ± 1.1 | 0.9 | 1.54 | n.s. | 39 ± 1.9 | 1.2 |
| Heart | 68 ± 19 | 0.4 | 62 ± 8.0 | 0.9 | 1.09 | n.s. | ||
| Trachea | 51 ± 3.0 | 1.5 | ||||||
| Ovary | 42 ± 6.0 | 0.6 | ||||||
| Virgin Spermatheca | 76 ± 30 | 1.1 | ||||||
| Mated Spermatheca | 98 ± 10 | 1.4 | ||||||
| Testis | 28 ± 4.0 | 0.2 | ||||||
| Accessory glands | 42 ± 3.4 | 0.3 | ||||||
| Carcass | 82 ± 19 | 0.5 | 69 ± 12 | 1.0 | 1.18 | n.s. | 42 ± 3.6 | 1.2 |
| Rectal pad | 233 ± 27 | 1.5 | 267 ± 2.0 | 3.7 | 0.87 | n.s. | ||
| Garland cells | 78 ± 13 | 2.3 | ||||||
| Whole body | 158 ± 12 | 72 ± 2.5 | 2.2 | p < 0.01 | 34 ± 1.4 | |||
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| Transcript | Male | Female | Larval | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | ID | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ts | Ag | Cs | Rp | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ov | Vs | Ms | Cs | Rp | Ns | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Tr | Cs | Ga |
| RA | FBtr0089510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RB | FBtr0089511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RC | FBtr0089509 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RD | FBtr0089512 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RE | FBtr0089513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RF | FBtr0089514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RG | FBtr0089515 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH | FBtr0089516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RI | FBtr0300191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RJ | FBtr0333324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RK | FBtr0333325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*Tissue Comparability:
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.
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