FlyAtlas 2 – Gene
For a particular Drosophila gene, find the pattern of expression in different tissues.
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Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene:
| Adult Male | Adult Female | Male v. Female | Larval | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tissue | FPKM | Enrichment | FPKM | Enrichment | M/F | p value | FPKM | Enrichment |
| Head | 50 ± 3.0 | 1.1 | 61 ± 9.5 | 0.8 | 0.83 | n.s. | ||
| Eye | 46 ± 2.1 | 1.0 | 59 ± 1.4 | 0.8 | 0.78 | n.s. | ||
| Brain / CNS | 50 ± 3.0 | 1.1 | 51 ± 2.6 | 0.7 | 0.97 | n.s. | N.A. | N.A. |
| Thoracicoabdominal ganglion | 33 ± 0.2 | 0.7 | 37 ± 2.8 | 0.5 | 0.88 | n.s. | ||
| Crop | 48 ± 2.6 | 1.1 | 39 ± 9.5 | 0.5 | 1.24 | n.s. | ||
| Midgut | 61 ± 3.7 | 1.4 | 56 ± 7.2 | 0.7 | 1.08 | n.s. | 50 ± 5.8 | 1.0 |
| Hindgut | 53 ± 3.8 | 1.2 | 51 ± 3.8 | 0.7 | 1.04 | n.s. | 37 ± 13 | 0.7 |
| Malpighian Tubules | 51 ± 10 | 1.1 | 81 ± 2.9 | 1.1 | 0.63 | p < 0.05 | 34 ± 2.0 | 0.7 |
| Fat body | 56 ± 4.3 | 1.3 | 78 ± 7.5 | 1.0 | 0.72 | p < 0.05 | 43 ± 1.7 | 0.9 |
| Salivary gland | 47 ± 1.3 | 1.1 | 45 ± 4.8 | 0.6 | 1.05 | n.s. | 55 ± 11 | 1.1 |
| Heart | 72 ± 2.9 | 1.6 | 112 ± 18 | 1.5 | 0.64 | n.s. | ||
| Trachea | 128 ± 12 | 2.6 | ||||||
| Ovary | 86 ± 2.0 | 1.1 | ||||||
| Virgin Spermatheca | 91 ± 6.0 | 1.2 | ||||||
| Mated Spermatheca | 100 ± 18 | 1.3 | ||||||
| Testis | 28 ± 4.9 | 0.6 | ||||||
| Accessory glands | 128 ± 35 | 2.9 | ||||||
| Carcass | 43 ± 3.8 | 1.0 | 69 ± 2.3 | 0.9 | 0.62 | p < 0.01 | 43 ± 2.5 | 0.9 |
| Rectal pad | 42 ± 3.3 | 1.0 | 44 ± 1.2 | 0.6 | 0.97 | n.s. | ||
| Garland cells | 73 ± 4.5 | 1.5 | ||||||
| Whole body | 45 ± 1.6 | 75 ± 9.0 | 0.59 | p < 0.05 | 49 ± 10 | |||
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| Transcript | Male | Female | Larval | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | ID | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ts | Ag | Cs | Rp | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ov | Vs | Ms | Cs | Rp | Ns | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Tr | Cs | Ga |
| RA | FBtr0078652 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RB | FBtr0078651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RC | FBtr0078649 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RD | FBtr0078650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RE | FBtr0078653 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RF | FBtr0078654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH | FBtr0301947 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RI | FBtr0302597 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RJ | FBtr0309319 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RK | FBtr0309320 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RL | FBtr0309321 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RM | FBtr0309322 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*Tissue Comparability:
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.