FlyAtlas 2 – Gene
For a particular Drosophila gene, find the pattern of expression in different tissues.
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Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene Name (e.g. viking)
Annotation Symbol (e.g. CG16858)
Gene ID (e.g. FBgn0016075)
Gene:
| Adult Male | Adult Female | Male v. Female | Larval | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tissue | FPKM | Enrichment | FPKM | Enrichment | M/F | p value | FPKM | Enrichment |
| Head | 42 ± 1.4 | 1.6 | 41 ± 4.8 | 0.9 | 1.02 | n.s. | ||
| Eye | 39 ± 4.9 | 1.5 | 35 ± 4.9 | 0.8 | 1.09 | n.s. | ||
| Brain / CNS | 47 ± 1.2 | 1.9 | 45 ± 4.7 | 1.0 | 1.05 | n.s. | 99 ± 3.2 | 2.6 |
| Thoracicoabdominal ganglion | 29 ± 0.7 | 1.1 | 32 ± 1.2 | 0.7 | 0.91 | n.s. | ||
| Crop | 31 ± 4.8 | 1.2 | 30 ± 6.5 | 0.7 | 1.02 | n.s. | ||
| Midgut | 26 ± 2.1 | 1.0 | 24 ± 0.7 | 0.5 | 1.07 | n.s. | 22 ± 1.3 | 0.6 |
| Hindgut | 28 ± 1.3 | 1.1 | 28 ± 2.3 | 0.6 | 0.97 | n.s. | 29 ± 7.9 | 0.8 |
| Malpighian Tubules | 24 ± 4.3 | 0.9 | 30 ± 2.4 | 0.7 | 0.79 | n.s. | 28 ± 2.9 | 0.7 |
| Fat body | 28 ± 0.7 | 1.1 | 26 ± 3.1 | 0.6 | 1.10 | n.s. | 54 ± 5.2 | 1.4 |
| Salivary gland | 32 ± 0.1 | 1.3 | 33 ± 9.2 | 0.7 | 0.96 | n.s. | 57 ± 4.5 | 1.5 |
| Heart | 33 ± 7.7 | 1.3 | 47 ± 6.0 | 1.0 | 0.69 | n.s. | ||
| Trachea | 46 ± 5.8 | 1.2 | ||||||
| Ovary | 56 ± 3.4 | 1.2 | ||||||
| Virgin Spermatheca | 27 ± 2.3 | 0.6 | ||||||
| Mated Spermatheca | 35 ± 6.6 | 0.8 | ||||||
| Testis | 26 ± 4.0 | 1.0 | ||||||
| Accessory glands | 43 ± 1.4 | 1.7 | ||||||
| Carcass | 18 ± 1.1 | 0.7 | 25 ± 2.3 | 0.6 | 0.70 | p < 0.05 | 42 ± 1.1 | 1.1 |
| Rectal pad | 21 ± 2.1 | 0.8 | 24 ± 3.6 | 0.5 | 0.86 | n.s. | ||
| Garland cells | 49 ± 1.6 | 1.3 | ||||||
| Whole body | 26 ± 3.8 | 46 ± 1.5 | 0.56 | p < 0.01 | 37 ± 6.6 | |||
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| Transcript | Male | Female | Larval | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name | ID | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ts | Ag | Cs | Rp | Hd | Ey | Br | Tg | Cr | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Ht | Ov | Vs | Ms | Cs | Rp | Ns | Mg | Hg | Tu | Fb | Sg | Tr | Cs | Ga |
| RA | FBtr0082801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RB | FBtr0082802 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RC | FBtr0082806 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RD | FBtr0082803 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RF | FBtr0082804 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RI | FBtr0300586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RK | FBtr0300588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RM | FBtr0308195 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RN | FBtr0308196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RO | FBtr0308197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*Tissue Comparability:
See Docs for info on the chemistry used to sequence different tissues.
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